d3diary-ver0.05aがUTF-8環境で文字化け

なーおさん、お世話になります。

d3diary-ver0.05では文字化けせずに動作しておりましたが、trust_path側をver0.05aで上書きしたところ文字化けしてしまいました。
(trust_path)/modules/d3diary/languages/ja_utf8/ 配下の５つのPHPファイル全てがBOM付きになっているようですが、それが原因でしょうか？

環境は以下になります。
PHP 5.2.11
MySQL 5.0.67
Apache 2.2.13
XCL HD-1.0.4

よろしくお願い致します。